Full Metal Panic!

Après une mission de sauvetage, Sousuke Sagara, un mercenaire de l'inorganisation Mithril (organisation qui lutte contre le terrorisme) est investit d'une nouvelle mission consistant à protéger une jeune citoyenne japonaise du nom de Chidori Kaname. Pour assurer cette mission, il est assisté par deux autres mercenaires du nom de Mélissa Mao et Kurz Weber. Sousuke est transféré en tant que lycéen dans la même classe que Chidori afin de la protégée . Cependant, il n'est pas facile de protéger quelqu'un sans se faire remarquer et Sousuke à quelques difficultés à s'adapter a ce milieu paisible. Très vite, il se fait remarquer par tous le monde en passant pour un fana de guerre bizarre en provoquant plusieurs accidents......

Plus les jours passent et plus Sosuke a des difficultés pour assurer sa mission de protection en se faisant remarquer par Chidori et se faisant confisquer à chaque fois son arme. l'ennemi ne s'est toujours pas montré mais Sousuke à déjà fait pas mal de dégâts et pourtant cet ennemi complote avec un général de l'armé russe en secret afin de capturer Chidori. Après avoir sauvé Chidori, impliquée dans un accident de la route, Sousuke arrive à établir un premier « contact social » entre eux ....

Pendant que Mithril traque toujours les individus étant à la poursuite de Chidori notamment en détruisant une de leur base, Sousuke poursuit sa mission en apprenant à recycler les détritus en vu du voyage d'école qu'ils vont faire. Afin qu'il se repose un peu, Mélissa et Kurz prennent la relève mais au moment où ils pensent que tous danger est écarté, un individu escalade la façade de l'immeuble ou Chidori réside. Cet individu n'est autre que Shinji Kazama, camarade de classe de Chidori, qui est venu dérober ses sous-vêtements afin de récupérer ses négatifs que ses amis lui on pris. Surpris lorsqu'il découvre la vérité, Sosuke ne trouve rien de mieux que de discuter avec Shinji sur le balcon de Chidori. Lorsqu'elle découvre les 2 compères son sur son balcon, petite culotte dans la main, Chidori ne peux que s'énerver et jeter comme il se doit ces 2 vicieux. Alors que le voyage scolaire commence, une tension se fait ressentir entre les 2 personnages à cause de cet évènement.

L'avion viens de décoller de l'aéroport emmenant la classe vers son lieu de destination mais celui-ci est détourné par des terroristes dont le chef se nomme Gauron. C'est en atterrissant sur une base militaire d'un autre pays qu'ils découvrent qu'ils sont pris en otage. A ce moment, Sosuke, isolé face à l'ennemi, ne peux qu'attendre le meilleur moment pour agir et ainsi sauver tous les occupants de l'avion. En même temps, Chidori est emmenée afin de subir des expériences qui déterminerons si elle est oui ou non une « Whispered ». Sosuke parvient à s'échapper de l'avion afin de secourir Chidori tandit que Mithril échafaude un plan de sauvetage....

Sosuke arrive à temps pour sauver Chidori des expériences dont elle était le cobaye mais l'alerte à été donnée et les 2 personnes doivent fuir hors de la base. Cet à ce moment que Chidori découvre la véritable identité de Sousuke qui est obliger de se battre pour la protéger. Grâce au raid mené par Mithril, les otages son finalement sain et sauf mais un mystérieux AS piloté par Gauron tente à tous prix de mettre la main sur Chidori.

Chidori, Kurz et Sousuke tentent de fuir mais ils son très vite rattrapés par l'ennemi et son obligés de se défendre avec les moyens du bord. Grâce à un plan ingénieux, ils arrivent à donner leur position à Mithril qui de ce fait leurs envois l'Arbalest afin de détruire leurs ennemis et quitter cet endroit hostile.

Gauron a suivis les traces des fuyards et un combat entre les 2 AS s'engage. A ce moment, Sousuke n'a pas connaissance de la puissance que possède son AS mais et n'a aucune chance de gagner. Cependant grâce aux conseils que Chidori lui transmet inconsciemment, il arrive à faire marcher le Lambda Drive qui lui permet de battre Gauron. La menace étant écartée, ils peuvent fuir en direction du sous-marin. De retour au japon, Melissa conseil à Chidori d'oublier cette histoire pour son bien....

Une camarade de classe du nom de Inaba Mizuki dont le petit copain l'a laisser tomber pour tenter de sortir avec Chidori embarque Sosuke dans une histoire impossible après une altercation avec son ancien petit ami. En effet, Mizuki a promis de montrer son petit ami à ses amies mais comme il viens de la plaquer, Sousuke est obligé de le remplacer. Cependant, Sousuke est loin d'être un spécialiste de ce genre de situation même avec un entrainement intense, il répond toujours étrangement. Lorsque le jour de la rencontre avec les amies de Mizuki survient, Sousuke est très vite démasqué mettant tous le monde dans l'embarras, Mizuki la première.

Takuma Kugayama, un jeune garçon est arrêter dans un aéroport après avoir attaqué un employé. Il semblerait qu'il ai un lien avec l'organisation terroriste A21 mais aussi semblerait avoir la capacité de contrôler le lambda drive. De ce fait, il est transférer dans un bâtiment de haute sécurité. Dans le même temps, Sousuke continue sa mission de protection tout en poursuivant ses missions de lutte contre le terrorisme mais trouve toujours un moyen malgré lui d'énerver Chidori. Lors de l'arrivée de Tessa et du commandant Kalinin dans la base secrète où est retenu Takuma, la base est attaquée par ses alliés et Tessa est obligée de prendre la fuite avec ce terroriste. Elle trouve refuge dans l'appartement de Sousuke en attendant son retour. Voulant se faire pardonner pour son attitude agressive, Chidori apporte un bento à Sousuke mais découvre qu'une jolie fille habite avec lui.....

Après avoir résolu le mal entendu sur la présence de Tessa dans l'appartement, elle apprend toute l'histoire concernant la situation actuelle et les dangers qui en découle. C'est par hasard qu'ils découvrent l'émetteur implanté en Takuma qu'il décident de détruire grâce à un micro onde. Pour plus de sureté ils vont au Lycée Jindaï afin de minimiser les risques d'impliquer d'autres personnes . En subtilisant le portable de Chidori, Takuma arrive à prévenir ses amis de sa position et ils ne tardent pas à venir prenant Chidori et Tessa en otage lorsque celles ci sont dans les toilettes. S'organise alors un échange d'otage qui tourne mal et qui met la vie de chacun en danger. Pendant ce temps, le commandant Kalinin est retenu en otage par le groupe terroriste qui souhaite avoir des informations sur Mithril et le Lambda Drive.

Chidori et Tessa sont emmenées dans le repaire des terroristes qui se trouve être un bateau et sont utilisées afin d'obliger Kalinin à parler. Dans le même temps, Sousuke pars à leur poursuite avec Kurz et Mélissa et arrive finalement à leur repaire. Cependant, bien qu'il rejoignent Kalinin et les 2 jeunes filles, ils ne peuvent empêcher l'activation du Béhémoth, un gigantesque AS piloté par Takuma qui a pour mission de détruire la ville.

Chidori, Tessa, Kurz et Sousuke essayent d'échapper au Béhémoth à bord de leur véhicule de fortune. Kurz parvient à déstabiliser l'engin titanesque mais ne peut le détruire. Pour avoir une chance de détruire ce monstre, Tessa demande l'envoi de l'Arbalest qui se trouve dans le Tuatha de Danaan. Une fois l'Arbalest arrivé à destination, Sousuke en prend les commandes et arrive finalement à vaincre la bête.

Une dispute éclate entre Tessa et Mélissa, Tessa accusant Mélissa d'être débauchée et Mélissa accusant Tessa de ne pas savoir ce qu'est le combat. Pour mettre un terme à cette dispute, Tessa accepte de se battre en duel contre Mélissa avec des AS. Cependant, Tessa n'a jamais piloter d'AS et demande conseil auprès de Sousuke. Au bout de quelques heures, elle y arrive finalement et le duel peu enfin commencer. Finalement, Tessa arrive à battre Mélissa mais cette épreuve n'était en fait prévue que pour endurcir Tessa qui est trop «fragile»......

Pour les vacances d'été, selon une idée de Shinji, Sousuke ne trouve rien de mieux que d'emmener Chidori est ses amies à un festival de démonstration d'AS. L'équipe Nérima (dont le père de Shinji en fait parti) se fait toujours battre par les dragon rouges dont le chef essaye tant bien que mal de séduire Chidori. Mais cette année, ils peuvent compter sur le soutien Sousuke pour obtenir la victoire. Tous se joue sur la dernière épreuve qui oppose Chidori contre Sousuke ; mais qui va l'emporter ?

Pendant que Chidori et ses amis son sur la plage en train de s'amuser, Sousuke est envoyé en mission au Helmajistan à la poursuite de Gauron. Il doit faire équipe avec d'autres mercenaires de Mithril avec qui il a des difficultés d'intégration. Une fois sur le terrain, ils s'aperçoivent que ce groupe terroriste transporte une tête nucléaire et plusieurs d'entre eux sont blessés au cours de l'attaque. L'équipe de Sousuke arrive à s'enfuir avec le tête nucléaire mais a perdu des plumes pendant bataille.

Traquer par l'ennemi, Sousuke et son équipe trouve refuge dans un repaire situer dans un canyon. Pendant son enfance, Sousuke et les rebelles utilisèrent ce repaire comme base de repli. Sousuke a choisi ce repaire car il est sûr que personne ne trouvera ici. Cependant, Zaïed un de ces anciens compagnon rebelle fait parti de l'équipe dirigée par Gauron et ne tarde pas à découvrir l'endroit ou se cache Sousuke.

Un combat s'engage entre Mithril et les terroristes lorsque ceux-ci découvre le repaire. Alors que Sousuke se bat en duel contre son ancien camarade d'arme, Gauron en profite pour éliminer un à un les autres mercenaires. Sousuke parviens à éliminer Zaïed et à ramener la tête nucléaire mais toute son équipe a été décimée.

Pour se faire pardonner après avoir encore fait des bourdes, Sousuke emmène Chidori sur une île du sud. Alors qu'ils sont dans l'avion, un imprévu survient et ils sont obligés de sauter en parachute en pleine mer pour être recueillis par le Tuatha de Danaan. Une fois dans le sous marin, Tessa explique la situation à Chidori et organise une petite fête pour son arrivée. Dans le même temps, une base est attaquée par Gauron que l'on croyait mort.

Chidori, Tessa et Mélissa se retrouves pour prendre un bain. Pendant la discussion, Mélissa raconte comment elle a rencontrée Kurz et Sousuke.

Tessa explique à chidori ce qu'est un Whispered mais avoue quelle ne sait pas vraiment elle même. Alors que le Tuatha de Danaan fait route vers l'ile de Melida, Les mercenaires de Mithril échafaudent un plan afin de reprendre l'île où se tient Gauron et ses acolytes. Cependant, ils auront fort à faire à cause du Venom, un AS très puissant possédant le Lambda Drive et piloté par Gauron lui même. Les combats fonts rages et Mélissa est blessée; Gauron est coriace et Sousuke a du mal à le battre mais finalement, il se rend à cause d'une surchauffe de son AS.

Gauron s'étant rendu, il est emmené comme le Venom dans le sous-marin comme prisonniers mais cela intrigue Kalinin. Mélissa étant blessée, Sousuke rejette la faute sur lui même et devient même désagréable avec Chidori. Ayant pris conscience du mal qu'il a fait à Chidori, Sousuke tente désespérément de la retrouvée. En même temps, Gauron réussi à s'échapper de sa cellule aidé par des traites infiltrés dans les rangs de Mithril et investissent le poste de commandement. Pour éviter toute résistance, ils font croire à un exercice d'évacuation afin d'isoler tous le personnel dans le hangar.

Le Tuatha de Danaan est désormais aux main de Gauron, mais est pris en chasse par le Pasadena. Tessa communiquant avec Chidori par la pensée, elle permet à Chidori de s'enfuir et lui prodigue les conseils dont elle a besoin afin de contrer Gauron. Pour punir Tessa d'avoir fait diversion, Gauron décide de détruire le premier bateau aux alentours afin que cela sert d'exemple. Dans le même temps, Kurz et Sousuke qui avaient sentis que quelque chose ne tournai pas rond essayent de contrecarrer les plans des terroristes. Rattraper par les acolytes de Gaurons, Chidori est finalement sauvée par Sousuke mais lorsque cela se produit, un sonar d'attaque se fait entendre, celui du Pasadena.

Pendant que Kurz, aidé par Mélissa, combat un traite , Chidori arrive à la Lady Chapel et arrive à reprendre le contrôle du Tuatha de Danaan grâce à sa capacité de Whispered. Elle réussie à éviter les 2 torpilles lancées par l'autre sous-marin pendant que Sousuke arrive au poste de commandement afin de sauver Tessa. Alors que le Tuatha de Danaan remonte à la surface après que Tessa en ai repris le contrôle, Gauron tente de fuir à bord du Venom mais Sousuke l'empêche et un combat final débute dans le hangar entre ces deux personnages.

Le combat fait rage entre Sousuke et Gauron. Devinant que la fin est proche, Gauron décide d'activer l'auto destruction de son Venom et par la même occasion détruire le sous-marin et tous ces occupants. Par chance et aidé par Chidori, Sousuke arrive à éjecter le Venom hors du sous-marin par la rampe de lancement des AS avant qu'il n'explose. La menace étant écartée, le Tuatha de Danaan retourne à la base et Sousuke emmène Chidori dans son endroit secret.